Lynis in ra một báo cáo dài và nhiều màu trên terminal, rồi ghi đúng thứ đó vào /var/log/lynis-report.dat, theo một định dạng không ai muốn đọc đến lần thứ hai. Trang này phân tích tệp ấy và cho thấy lần chạy thực sự tìm được gì: hardening index, những cảnh báo cần xử lý, và các gợi ý kèm mã bài kiểm tra để bạn tra được mỗi mục có nghĩa gì.
hardening index là điểm trên thang 100, và nên nói thẳng: 100 không phải là đích. Lynis đề nghị siết chặt cho mọi kịch bản nó biết, kể cả những kịch bản không áp dụng cho máy chủ của bạn. Một dịch vụ lưu trữ web đứng quanh mức 78 mà từng cảnh báo đều được xem xét có ý thức thì ở trạng thái tốt hơn một máy đạt 90 bằng cách cài những gói nó không cần.
Trên một VPS thông thường, điều làm con số này dịch chuyển nhiều nhất là: tắt đăng nhập bằng mật khẩu qua SSH, thiết lập cập nhật bảo mật tự động, thêm một công cụ kiểm tra toàn vẹn tệp, và siết các tham số nhân qua sysctl. Mỗi điểm trong số đó đều có trang riêng trong bảng này.